„The Boxtrolls“ ist eine komödiantische Fabel, die sich in Cheesebridge abspielt, einer noblen Stadt aus der viktorianischen Zeit, die von Reichtum, Klasse und den stinkendsten Käsesorten besessen ist. Unter den bezaubernden Kopfsteinpflasterstraßen hausen die Boxtrolls, üble Monster, die nachts aus der Kanalisation kriechen und stehlen, was den Stadtbewohnern am meisten am Herzen liegt: ihre Kinder und ihren Käse. Zumindest ist das die Legende, an die die Bewohner immer geglaubt haben. In Wahrheit handelt es sich bei den Boxtrolls um eine unterirdische, in Höhlen lebende Gemeinschaft schrulliger und liebenswerter Sonderlinge, die recycelte Pappschachteln tragen, so wie Schildkröten ihre Panzer tragen. Die Boxtrolls haben einen verwaisten Menschenjungen, Eggs (gesprochen von Isaac Hempstead-Wright), seit seiner Kindheit als einen ihrer Freunde großgezogen, der Müllcontainer taucht und mechanischen Müll sammelt. Als die Boxtrolls ins Visier des bösartigen Schädlingsbekämpfers Archibald Snatcher (Oscar-Gewinner Ben Kingsley) geraten, der sie unbedingt ausrotten will, um ihm eine Eintrittskarte in die Cheesebridge-Gesellschaft zu verschaffen, muss sich die gutherzige Tüftlerbande an ihren adoptierten Schützling und ein abenteuerlustiges reiches Mädchen wenden Winnie (Elle Fanning) verbindet zwei Welten inmitten des Windes des Wandels – und des Käses.